Der Suchraum, in dem Linienvarianten entwickelt und untersucht werden, erstreckt sich von einem Raum westlich bis zu einem Raum östlich der Fährhäfen von Puttgarden und Rødbyhavn. Es werden Linienvarianten untersucht, die Punkte westlich Puttgardens und westlich Rødbyhavns miteinander verbinden (West-West), östlich Puttgardens und östlich Rødbyhavns (Ost-Ost) sowie weitere Varianten, z.B. diagonal von Ost nach West usw. (siehe Abbildung). Dieser Planungsschritt ist als Teil des Planfeststellungsprozesses in beiden Ländern verbindlich vorgeschrieben.

Eine Antwort auf die Frage, welche Linienvariante mit den geringsten nachteiligen Auswirkungen verbunden sein wird, wird anhand eines Kriterienkataloges ermittelt, der u.a. folgende Kriterien berücksichtigt: umweltbezogene Empfindlichkeit einschließlich FFH- und Vogelschutzgebieten, Sicherheit der Seeschifffahrt (insbesondere in Bezug auf den Fährverkehr), bestehende Unterwasser-Versorgungseinrichtungen, Auswirkungen auf die regionale und örtliche Entwicklung sowie auf ländliche Siedlungsstrukturen, technische Trassierungsmöglichkeiten einschließlich der Anbindung an das bestehende Verkehrsnetz sowie Kostengesichtspunkte. Es werden Linienvarianten sowohl in Hinblick auf Brücken- als auch Tunnellösungen betrachtet.

Die möglichen Linienvarianten sind Gegenstand eines ersten Bewertungsdurchgangs, werden optimiert und anschließend nochmals bewertet, solange bis die ersten – ungünstigsten – Linienvarianten von der weiteren Betrachtung ausgeschieden werden können. Die verbleibenden Linienvarianten werden dann anhand schrittweise verfeinerter Bewertungskriterien erneut beurteilt. Dieser sorgfältig dokumentierte Prozess wird schließlich zu nur noch einer oder wenigen Linienvarianten führen, die die geringsten nachteiligen Auswirkungen haben und die die Femern A/S als ihre Vorzugs-Linie(n) präsentieren wird. Dieser anspruchsvolle Abschichtungsprozess wird sich bis Ende 2010 erstrecken. Über die endgültige Linienführung werden dann die zuständigen deutschen und dänischen Behörden im Rahmen der Planfeststellungsverfahren entscheiden.