Das Schiff ist mit modernsten Instrumenten zur Messung von Strömung, Salzgehalt, Temperatur usw. auf See ausgestattet. Darüber hinaus verfügt es über eine Anzahl von Probenahmegeräten und Netzen für biologische Untersuchungen.

Das Schiff JHC Miljø ist auch für die mehr als
35 automatischen Messstationen auf See verantwortlich, die im geplanten Trassenkorridor der festen Querung und in der Mecklenburger Bucht ausgesetzt sind und dort unter anderen den Sauerstoffgehalt, den Salzgehalt und die Temperatur des Wassers messen. Diese Bojen reichen bis auf eine Wassertiefe von 25 Metern. Die Daten werden alle zwei Meter erfasst.

Andere Messstationen in der Nähe der Küste des Fehmarnbelts messen die Feinstaub-konzentration im Wasser. Weitere Messstationen erfassen die Laute der Schweinswale im Fehmarnbelt.

Alle diese Daten werden für die Umweltverträglichkeitsprüfung und die Planung des Bauvorhabens auf See benötigt.

Die Untersuchungen haben Ende 2008 begonnen und werden erst in etwa zwei Jahren beendet sein.